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全球最多人参与的公益项目BOINC

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  • TA的每日心情
    奋斗
    2013-4-13 12:49
  • 签到天数: 2 天

    [LV.1]初来乍到

    发表于 2012-4-8 21:45:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    BOINC
    伯克利开放式网络计算平台(Berkeley Open Infrastructure for Network Computing,简称BOINC)是目前主流的分布式计算平台之一,由加州大学伯克利分校的电脑学系发展出来的分布式计算系统。它本身设计成用于SETIhome项目,但逐渐在其他领域包括数学、医学、天文学、气象学等。BOINC现时旨在为各研究者提供汇集全球各地大量个人电脑的强大运算能力。直至2012年3月25日,BOINC活跃: 290,743 志愿者, 472,834 计算机。
    24 小时平均: 6.300 PetaFLOPS.

    运行原理安装BOINC软件的个人电脑在闲置时会使用个人电脑的CPU进行运算。即使个人电脑正被使用,假如仍有空闲的CPU周期,BOINC也会用作计算。如果使用者的电脑装有支持NVIDIA CUDA或ATI Stream技术的图形处理器(GPU),某些BOINC项目的计算速度将比单纯使用CPU的版本提高2至10倍[2]。
    当参与者使用个人电脑参与BOINC项目时,BOINC会与项目的服务器通信,服务器会向个人电脑提供工作包(Workunit,简称为WU),然后个人电脑会对工作包作出运算。完成后BOINC会把结果上传至项目的服务器。
    每个项目有它的服务器,它用作协调各参与电脑的工作,包括发送工作包、接收已处理的结果、核对大量的结果再作处理,成为研究人员需要的数据。由于个别的个人电脑可能会在运算过程出现错误,所以服务器一般会把同一工作包传送至多个参与者,并比较各个结果。
    BOINC设有积分系统,积分间接反映参与者的贡献。因为在BOINC上可以运行的项目千差万别,比如项目A的工作包在某台电脑上需要3个小时完成,而项目B的工作包在该电脑上需要30个小时才能完成,显然用完成的工作包的数目来衡量工作量是不可行的;类似的,电脑性能也有差别,用CPU时间来衡量工作量更是不行的。积分系统只能通过一定的算法得到参与者实际完成的计算量。
    BOINC 从版本 6.4.5 起,开始支持GPU运算,目前有GPUgrid.net、SETIhome、Milkywayhome、AQUAhome、Collatz Conjecture、DNETCHome等多个GPU 专案。

    说白了就是下载一个数据包程序运行,再把数据包,返回总站上。

    详细操作和下载请到 中国分布式计算总站




    项目
    旧BOINC标志随着BOINC普及,越来越多研究都使用BOINC,以下是依功能分类的项目列表: (粗体显示代表重要工程)
    生物学、医学DockingHome — 研究更深入的蛋白质键结和反应的原子等级构造和细节,并借由其研究结果来研发药物以治疗人类疾病。
    DrugDiscoveryHome — 研发药物以治疗人类疾病。
    Malaria Control — 模拟疟疾的影响及控制。
    Predictorhome — 预测蛋白质的结构,目前已停止运作。
    Proteinshome — 推论DNA的次序,目前已停止运作。
    GPUGRID.net — 研究分子生物动力学相关的研究,主要运行环境为支援CUDA的NVidia GPU。
    Rosettahome — 研究蛋白质的折叠。
    RALPHHome — RosettaHome的测试专案。
    SIMAP(Similarity Matrix of Proteins) - 一个蛋白质同源计算序列并可以对这些序列数据提供专业的检索工具的数据库。
    TANPAKU—利用布朗动力学方法计算蛋白质的结构,目前已停止运作。
    POEMHOME — 利用能量法来研究蛋白质的结构。
    MindModelingHome — 研究人类脑部的认知科学。
    SuperlinkTechnion — 帮助科学家研究人类基因及其异常所产生的疾病。
    The Lattice Project — 美国马里兰大学的研究生物资讯学领域相关的分布式计算平台。
    Virtual Prairie
    CelsHome
    RNA world —研究分析生物中RNA的分子结构。
    DNAHome—研究有关生物中DNA的基因调控作用。
    气象学和地球科学Climateprediction.net(CPDN)— 预测廿一世纪的气候。
    BBC Climate Change Experiment — 与英国广播公司合作的项目,结果已制作成纪录片,目前已停止运作并并入Climateprediction.net的主计划中。
    Seasonal Attribution Project — 研究引致极端气候的人为因素。
    CPDN Beta — Climateprediction.net的测试专案。
    Quake Catcher Network — 利用分布在全球各地电脑的传感器来侦测和研究地震现象。
    物理/化学/天文学EinsteinHome — 搜寻脉冲星的引力波。
    CosmologyHome — 研究宇宙的模型及其相关的物理天文学资讯。
    Leiden Classical — 模拟在经典物理环境下的各种分子和原子。
    LHChome — 模拟粒子加速,协助设计及改善LHC粒子加速器。
    Test4Theory
    LHChome Alpha — 测试LHChome,目前已停止运作。
    NanoHiveHome — 精确的模拟和研究纳米分子的结构系统和特性,目前已停止运作。
    Orbithome — 计算近地小行星的轨道路径,以预防其碰撞地球而对地球造成损害。
    QMCHome — 发展在量子化学领域广泛使用的量子统计模拟方法。
    SETIhome — 搜索外太空文明。
    SETIhome beta — 测试SETIhome。
    μFluidsHome — 模拟微重力和微流体力学问题的两相现象。
    Milkywayhome — 研究银河系的重力波,支援NVidia CUDA及ATi的显卡运算。
    Spinhengehome — 研究纳米磁性分子的物理特性。
    BRaTShome — 进行引力波束追踪的相关计算,目前已停止运作。
    EDGeSHome
    HydrogenHome — 研究以氢作为动力的干净能源。
    Magnetismhome
    SLinCAHome— 研究物理及材料科学领域。
    Eon—利用理论化学方法来研究凝聚态物理学和材料科学。
    数学ABCHome — 尝试解决ABC猜想。
    Chess960Home — 研究菲舍尔任意制象棋的开局理论并建立巨型的国际象棋棋局数据库。
    NQueenshome — 解决国际象棋的N皇后问题,目前已停止运作。
    PrimeGrid — 尝试把巨大的数字进行因式分解。
    Rectilinear Crossing Number — 研究平面中最少的交叉数问题,目前已停止运作。
    RieselSieve — 寻找k*2^n-1形式的素数,显示k=509203是最小的黎瑟尔斯数,目前已停止运作。
    SZTAKI Desktop Grid — 搜索广义二进制数系。
    Collatz Conjecture — 研究考拉兹猜想。
    NFSHome
    Sudoku project — 研究数独问题,目前已停止运作。
    RamseyHome— 研究拉姆西数,目前已停止运作。
    Reversi — 研究黑白棋游戏,目前已停止运作。
    WEP-M+2 Project — 使用WEP算法对2^p+1进行因式分解。
    Sudokuvtaiwan— 由台湾的交通大学推出的计划,目的在研究数独问题。
    DNETCHOME
    电脑/资讯科技World Community Grid — 由IBM主持,主要目的为利用分布式计算来帮助寻找人类疾病的治疗方法,和改善人类生活的相关研究。
    AQUAhome — 帮助设计量子电脑,目前已停止运作。
    BURP — 处理及创作三维动画。
    DepSpid — 互联网搜寻器,目前已停止运作。
    EnigmaHome — 尝试破解第二次世界大战时由恩尼格玛密码机传送的原始讯息。
    HashClash
    Project Neuron — 测试BOINC框架,目前已停止运作。
    SHA-1 Collision Search Graz — 密码学:寻找 SHA-1 碰撞,目前已停止运作。
    VTUHome — 软件测试:提供分散式计算平台,改善BOINC。
    IBERCIVIS — 提供西班牙科学研究的分散式计算平台。
    DistrRTgen — 利用BOINC的分布式运算产生彩虹表(英文)。
    SZTAKI Desktop Grid — 找出所有直到11维的广义二进制数系。
    yoyohome — 利用BOINC的封装技术将现有的分布式计算项目引入到BOINC平台,支援PS3运算。
    Pirateshome — 测试BOINC专案。
    XtremLab — 研究并改善网格计算,包括BOINC本身,目前已停止运作
  • TA的每日心情
    开心
    2017-5-12 21:45
  • 签到天数: 418 天

    [LV.9]以坛为家II

    发表于 2012-4-9 09:16:22 | 显示全部楼层
    貌似不错!
  • TA的每日心情
    擦汗
    2012-7-25 09:23
  • 签到天数: 138 天

    [LV.7]常住居民III

    发表于 2012-4-9 14:34:50 | 显示全部楼层
    不是很懂
  • TA的每日心情
    奋斗
    2013-4-13 12:49
  • 签到天数: 2 天

    [LV.1]初来乍到

     楼主| 发表于 2012-4-11 12:39:42 | 显示全部楼层
    wangshaoqi 发表于 2012-4-9 14:34
    不是很懂

    就是把一个很大的程序,分割成一小段运行,然后把返回的程序组合。

    就是蚂蚁搬家的方式!
  • TA的每日心情
    擦汗
    2012-7-25 09:23
  • 签到天数: 138 天

    [LV.7]常住居民III

    发表于 2012-4-11 14:45:32 | 显示全部楼层
    picccctv 发表于 2012-4-11 12:39
    就是把一个很大的程序,分割成一小段运行,然后把返回的程序组合。

    就是蚂蚁搬家的方式!

    嗯,有点晕
  • TA的每日心情
    开心
    2013-12-7 21:52
  • 签到天数: 80 天

    [LV.6]常住居民II

    发表于 2012-4-13 13:37:31 | 显示全部楼层
    虽然看不懂,顶顶~
  • TA的每日心情
    奋斗
    2013-4-13 12:49
  • 签到天数: 2 天

    [LV.1]初来乍到

     楼主| 发表于 2012-4-29 21:47:28 | 显示全部楼层
    目前世界有许多能为人类造福的项目都因计算不足而搁浅,或者没有很快完成!因此,我呼吁大家利用CPU的闲置计算能力,帮忙做做计算,也是为人类做贡献!通过加入分布式计算,你就可以为这些项目出一份力,大家可以进入******中国分布式计算总站******下载客户端,然后选择自己感兴趣的项目,加入以后就是自动下载任务,自动计算,自动上传结果,并且计算的优先级是最小的,也就是说只有CPU空闲时才计算,如果你有任务,CPU会优先计算你的任务,因此电脑一点都不卡,还可以手动调节CPU的利用率

    BOINC和Folding@home的成果都是公开的

    中国大量生物、医药类研究引用了Folding@home的研究成果
    如:

    《药物发现网格设计与实现》
    张文举[1] 陈曙东[1] 刘了[3] 马范援[1] 沈建华[2]
    [1]上海交通大学计算机系,上海200030 [2]中科院上海药物研究所,上海201203 [3]江南计算技术研究所,无锡214083
    http://www.cqvip.com/qk/95200x/2006011/21997637.html

    《一种分布式网格计算框架以及在大规模分子动力学模拟中的应用》
    王文睿[1] 陈国良[1] 邢利荣[2] 陈华平[1] 孙广中[1] 单久龙[1]
    [1]中国科学技术大学国家高性能计算中心,安徽合肥230027 [2]上海电力学院数理系,上海201300
    http://www.cqvip.com/qk/95659x/2006007/22207692.html

    《GROMOS96分子动力学模拟的并行优化算法》
    王文睿 陈国良 孙广中
    中国科学技术大学计算机系国家高性能计算中心,合肥230027
    http://www.cqvip.com/qk/94257x/2004001/9223909.html



    国内有研究蛋白质折叠的学校、科学院也是非常多的,学生也很多

    学校和研究室有:

    北京工业大学生命科学与生物工程学院 “分子设计与蛋白质组学”研究室
    主要研究方向:用分子模拟与实验相结合的方法研究蛋白质分子结构和动力学性质以及结构与功能间的关系,设计具有新功能的蛋白质和药物。目前主要开展:(1)抗HIV药物设计与筛选;(2)蛋白质-蛋白质相互作用与识别研究;(3)蛋白质折叠机理的研究;(4)酶生化实验。这些都属于21世纪生命科学的热点研究领域。
    http://bioinformatics.bjut.edu.c ... search/lab/lab3.htm

    相关文章有:

    清华举办蛋白质折叠讲座暴满
    http://news.tsinghua.edu.cn/new/news.php?id=3799

    福州大学蛋白质折叠课件
    http://met.fzu.edu.cn/eduonline/ ... china/bjkc/ja8.html
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